#!/usr/bin/perl -w ####################################################################### ### Huang He ### ### take fasta file from original fasta by blasted(unfinished) file ### ####################################################################### ($b)=@ARGV; $c=$b+1; for($a=1;$a<$c;$a++){ open OUT,">test$a\.sh" or die "can't creat test$a\.sh"; print OUT "blastall -p blastx -d /for_blast/ncbi/nr/nr -i /for_blast/temp/predicted_mRNA_$a.fa -o /home/huanghe/research/50000440/Sample_Im1749/treatment_for_mRNA/predicted_mRNA_$a.blastx -v 10 -b 10 -a 12"; }